Organisasi Perangkat Daerah Pemerintah Kabupaten Magetan diatur dalam
Peraturan Daerah Kabupaten Magetan Nomor 15 Tahun 2016 Tentang Pembentukan dan Susunan Perangkat Daerah Kabupaten Magetan dan
Peraturan Bupati Magetan Nomor 87 Tahun 2020 Tentang Pencabutan Peraturan Bupati Mengenai Kedudukan, Susunan Organisasi, Tugas dan Fungsi serta Tata Kerja Perangkat Daerah Kabupaten Magetan